北京时间3月11日晚19时，2006赛季的F1揭幕战——巴林大奖赛的排位赛在巴林萨基尔赛道进行，最终车王舒马赫以1分31秒431的单圈最好成绩夺下杆位，另外一位法拉利车手马萨获得第二。本田车手巴顿排名第三。
本赛季的F1采用的新排位制度是三阶段淘汰制：第一个15分钟，淘汰最慢的6位车手；第二个15分钟，再淘汰最慢的6位车手；最后的20分钟，由余下的10位车手竞逐杆位。此外，在最后20分钟参加排位的10位车手必须在排位赛前便决定正赛时第一箱油的油量，而在前两个阶段被淘汰的12位车手则可以自由添加油量。
国际汽联采用的全新排位赛规则也似的首站赛事格外的引人关注。在排位赛开始的时候，巴林当地的天气温度为23摄氏度，赛道表面温度为33摄氏度，相对湿度47％。
第一阶段(15分钟)：
超级亚久里车手井出有治第一个驶上赛道，随后特鲁利、库塔、鲁伊兹、佐藤也相继出场，而由于现场的风比较大，赛道也有些脏，一些实力强劲的车手还在维修间观望。
第一阶段排位赛进行10分钟之后，红牛二队车手鲁伊兹以1分34秒439的单圈最好成绩暂时排在第一位。在最后的5分钟，芬兰冰人雷克南在进入左弯时候，赛车的右后轮胎锁死，结果导致他的赛车冲出赛道撞上护墙，雷克南只得勉强将赛车开回维修间，而他也因为没有做出成绩而被淘汰。
第一阶段还剩下4分多钟的时候，因为赛道上10号弯处有碎片，大会也亮起红旗，排位暂时中止。排位重新开始后，备受关注的雷诺车队两位车手阿隆索和费斯切拉才开始进入赛道，不过他们很快就跑出了领先的成绩。
由于所有的车手同时进行排位，所以场面上有些混乱，而第一阶段被淘汰的6位车手是：雷克南，井出有治，佐藤琢磨，蒙泰罗，阿尔伯斯，拉尔夫·舒马赫！！
第二阶段(15分钟)：
第二阶段一开始，鲁伊兹就驶上赛道，第5分钟时候，威廉姆斯车手罗斯伯格滑出赛道。而雷诺车手阿隆索则领先于第二阶段所有车手。在第二阶段被淘汰的6位车手是：维伦纽夫，罗斯伯格，库塔，特鲁利，鲁伊兹，斯皮德！
第三阶段(20分钟)：
法拉利车手马萨首先跑出计时，他的成绩为1分34秒908，而他的队友舒马赫更是跑出了1分31秒595的好成绩，车王也获得了第一位，很快马萨就将成绩刷新到1分31秒523。本田的两位车手巴顿和巴里切罗也不甘示弱，他们分别排在第三和第四。
最后时刻，这10位车手都开始全力冲刺，车王舒马赫以1分31秒431的单圈最好成绩夺下杆位，这也是车王个人职业生涯的第65个杆位，同时他也追平了塞纳塞纳创造的65个杆位纪录。巴西人马萨获得第二，本田车手巴顿排名第三。
F1巴林大奖赛的正式比赛将在北京时间3月12日晚19:30进行。
以下是排位赛的详细排位：
排位 车手 轮胎 成绩
01、迈克尔·舒马赫 法拉利 普利司通 1:31.431
02、马萨 法拉利 普利司通 1:31.478
03、巴顿 本田 米其林 1:31.549
04、阿隆索 雷诺 米其林 1:31.702
05、蒙托亚 迈凯轮 米其林 1:32.164
06、巴里切罗 本田 米其林 1:32.941
07、韦伯 威廉姆斯 米其林 1:33.006
08、克莱恩 红牛 米其林 1:33.112
09、费斯切拉 雷诺 米其林 1:33.4
10、海菲尔德 宝马·索伯 米其林 1:33.926
11、维伦纽夫 宝马·索伯 米其林 1:32.456
12、罗斯伯格 威廉姆斯 普利司通 1:32.620
13、库塔 红牛 米其林 1:32.850
14、特鲁利 丰田 普利司通 1:33.079
15、鲁伊兹 红牛之队 米其林 1:33.416
16、斯皮德 红牛之队 普利司通 1:34.606
17、拉尔夫·舒马赫 丰田 普利司通 1:35.581
18、阿尔伯斯 米德兰 普利司通 1:35.724
19、蒙泰罗 米德兰 普利司通 1:35.900
20、佐藤琢磨 超级亚久里 普利司通 1:38.868
21、井出有治 超级亚久里 普利司通 1:37.411
22、雷克南 迈凯轮 米其林 退赛
